A la fecha de hoy (26 de Abril de 2014) Parallels 9 tiene un error que no permite utilizar Ubuntu 14.04 al ser instalado.
Por suerte, encontré la solución y la copio pongo aquí para futuras referencias.
Una vez instalado Ubuntu 14.04 solo será visible el escritorio y nada más, por lo tanto es necesario ingresar a la terminal por medio de la siguiente combinación de teclas Ctrl+Alt+Fn+F1, luego ejecutamos lo siguiente comandos:
$ sudo mv /etc/X11/xorg.conf.[fecha] /etc/X11/xorg.conf
$ sudo rm -rf ~/.config
$ sudo rm -rf ~/.compiz
$ sudo reboot
Luego se va a reiniciar la máquina virtual y Parallels Tools podrá ser utilizado por el sistema permitiendo utilizar Ubuntu 14.04 y cambiar la resolución de pantalla.